RNAseq
RNA-seq – ukierunkowane sekwencjonowanie transkryptomu
SureSelect RNA Direct umożliwia utworzenie gotowej do sekwencjonowania biblioteki dla wybranych transkryptów. Podczas przygotowywania biblioteki nie ma osobnych etapów deplecji rRNA czy selekcji tylko transkryptów z polyA. Wychwycenie docelowych fragmentów RNA odbywa się dzięki hybrydyzacji do sond oligonukleotydowych SureSelect.
Za pomocą programu SureDesign lub przy współpracy z Perlan Technologies każdy może zaprojektować swój własny panel sond SureSelect, które umożliwią ukierunkowanie RNA-seq.
Rozwiązanie RNA Direct:
- jest kompatybilne również z materiałem o niskiej jakości np. izolowanym z FFPE,
- umożliwia identyfikację fuzji genowych
- umożliwia profilowanie ekspresji genów
W ofercie Agilent dostępne są dwa katalogowe panele do RNA-seq: All exon V6+UTR oraz Comprehensive Cancer panel obejmujący 150 genów.
